Le Chaetodon melannotus est tricolore avec un corps majoritairement jaune, noir et blanc. Il possède également des rayures diagonales de couleur noire. La partie supérieure du dos laisse apparaître un dégradé brun foncé à noir.
Dimorphisme non renseigné.
Le Chaetodon melannotus est un poisson vivant en couple ou en solitaire qui réside naturellement à proximité du fond. Il est parfois également observé en petits groupes. De manière générale, c'est un poisson indépendant qui ne se préoccupe guère des autres espèces. Il peut cependant montrer quelques signes d'agressivité envers ses congénères.
Le Chaetodon melannotus est un poisson ovipare qui pond en eau libre.
Le Chaetodon melannotus est un omnivore à tendance carnivore.
Le Chaetodon melannotus est un poisson-papillon présent de la mer rouge à la Micronésie. Il est également répertorié dans les récifs de l'île de la Réunion.